ปราศจากคอเลสเตอรอล เป็นแหล่งของกรดไขมันไม่อิ่มตัวที่สำคัญและจำเป็นต่อร่างกาย ที่ร่างกายไม่สามารถสังเคราะห์เองได้ กรดไขมันไม่อิ่มตัวหลายชนิดที่พบในน้ำมันถั่วเหลือง ทั้ง กรดไลโนเลอิก (โอเมก้า 6) และ กรดแอลฟาไลโนเลนิก (โอเมก้า 3) ที่พบในน้ำมันถั่วเหลืองมากกว่าในน้ำมันพืชชนิดอื่นๆ และมีประโยชน์ต่อสุขภาพ ช่วยลดความเสี่ยงของการเกิดโรคไขมันอุดตันในหลอดเลือด
